VieRnes de Bioinformática en el LIIGH

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####Dra. Evelia Coss 
#### 22/mayo/2026
]

.left[.footnote[R-Ladies Theme[R-Ladies Theme](https://www.apreshill.com/project/rladies-xaringan/)]]

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## Como inicio esta idea ...

Los principales pilares de los Viernes de Bioinformática:

- Retribuir
- Tiempo
- Conocimiento
- Paciencia
- Solidaridad
- Gratitud
]

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> Si he visto más lejos es porque estoy sobre los hombros de gigantes 
> — Isaac Newton.

]

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.content-box-blue[
Gracias a cada persona que ha sido parte de este camino. 
Este espacio es nuestra manera de **aprender, compartir y crecer juntos**.
]]

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# VieRnes de Bioinformática en el LIIGH
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**Objetivo**: Fomentar la formación y crecimiento en bioinformática a través de *cursos gratuitos* para toda la *comunidad interesada*.

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## VieRnes de Bioinformática LIIGH-UNAM

.pull-left[
- Fundado en septiembre 2023
- Organizadores: Dra. Evelia Coss y Dr. Israel Aguilar
- STAFF: Jorge Suazo
- **Impacto internacional** con participantes de países como: Argentina, Bolivia, Chile, Colombia, Costa Rica, El Salvador, Ecuador, Perú, Venezuela, Guatemala, España y Estados Unidos.

Redes sociales:

- Página web: https://viernesbioinformatica.github.io/

[<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 496 512" style="height:2em;width:1.94em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M165.9 397.4c0 2-2.3 3.6-5.2 3.6-3.3.3-5.6-1.3-5.6-3.6 0-2 2.3-3.6 5.2-3.6 3-.3 5.6 1.3 5.6 3.6zm-31.1-4.5c-.7 2 1.3 4.3 4.3 4.9 2.6 1 5.6 0 6.2-2s-1.3-4.3-4.3-5.2c-2.6-.7-5.5.3-6.2 2.3zm44.2-1.7c-2.9.7-4.9 2.6-4.6 4.9.3 2 2.9 3.3 5.9 2.6 2.9-.7 4.9-2.6 4.6-4.6-.3-1.9-3-3.2-5.9-2.9zM244.8 8C106.1 8 0 113.3 0 252c0 110.9 69.8 205.8 169.5 239.2 12.8 2.3 17.3-5.6 17.3-12.1 0-6.2-.3-40.4-.3-61.4 0 0-70 15-84.7-29.8 0 0-11.4-29.1-27.8-36.6 0 0-22.9-15.7 1.6-15.4 0 0 24.9 2 38.6 25.8 21.9 38.6 58.6 27.5 72.9 20.9 2.3-16 8.8-27.1 16-33.7-55.9-6.2-112.3-14.3-112.3-110.5 0-27.5 7.6-41.3 23.6-58.9-2.6-6.5-11.1-33.3 2.6-67.9 20.9-6.5 69 27 69 27 20-5.6 41.5-8.5 62.8-8.5s42.8 2.9 62.8 8.5c0 0 48.1-33.6 69-27 13.7 34.7 5.2 61.4 2.6 67.9 16 17.7 25.8 31.5 25.8 58.9 0 96.5-58.9 104.2-114.8 110.5 9.2 7.9 17 22.9 17 46.4 0 33.7-.3 75.4-.3 83.6 0 6.5 4.6 14.4 17.3 12.1C428.2 457.8 496 362.9 496 252 496 113.3 383.5 8 244.8 8zM97.2 352.9c-1.3 1-1 3.3.7 5.2 1.6 1.6 3.9 2.3 5.2 1 1.3-1 1-3.3-.7-5.2-1.6-1.6-3.9-2.3-5.2-1zm-10.8-8.1c-.7 1.3.3 2.9 2.3 3.9 1.6 1 3.6.7 4.3-.7.7-1.3-.3-2.9-2.3-3.9-2-.6-3.6-.3-4.3.7zm32.4 35.6c-1.6 1.3-1 4.3 1.3 6.2 2.3 2.3 5.2 2.6 6.5 1 1.3-1.3.7-4.3-1.3-6.2-2.2-2.3-5.2-2.6-6.5-1zm-11.4-14.7c-1.6 1-1.6 3.6 0 5.9 1.6 2.3 4.3 3.3 5.6 2.3 1.6-1.3 1.6-3.9 0-6.2-1.4-2.3-4-3.3-5.6-2z"/></svg>](https://github.com/VieRnesBioinformatica) [<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 576 512" style="height:2em;width:2.25em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M549.655 124.083c-6.281-23.65-24.787-42.276-48.284-48.597C458.781 64 288 64 288 64S117.22 64 74.629 75.486c-23.497 6.322-42.003 24.947-48.284 48.597-11.412 42.867-11.412 132.305-11.412 132.305s0 89.438 11.412 132.305c6.281 23.65 24.787 41.5 48.284 47.821C117.22 448 288 448 288 448s170.78 0 213.371-11.486c23.497-6.321 42.003-24.171 48.284-47.821 11.412-42.867 11.412-132.305 11.412-132.305s0-89.438-11.412-132.305zm-317.51 213.508V175.185l142.739 81.205-142.739 81.201z"/></svg>](https://www.youtube.com/@viernesdebioinfoliigh)

]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/ViernesBioinfo_logo.png" alt="" width="80%" style="display: block; margin: auto;" />
]

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## VieRnes de Bioinformática LIIGH-UNAM

- VieRnes de Bioinformática en el LIIGH [Parte 0](https://github.com/EveliaCoss/ViernesBioinfo2023) - (22 sep - 9 dic, 2023) 
- VieRnes de Bioinformática en el LIIGH [Parte 1](https://github.com/EveliaCoss/ViernesBioinfo2024) - (2 feb - 2 de agosto, 2024) 
- VieRnes de Bioinformática en el LIIGH [Parte 2](https://github.com/EveliaCoss/ViernesBioinfo2024_parte2) - (7 sep - 6 de dic, 2024) 
- VieRnes de Bioinformática en el LIIGH [Parte 3](https://github.com/VieRnesBioinformatica/ViernesBioinfo2025_parte3) - (7 feb - 6 de junio, 2025) 
- VieRnes de Bioinformática en el LIIGH [Parte 4](https://github.com/VieRnesBioinformatica/ViernesBioinfo2025_parte4) - (5 sep - 9 de dic, 2025) 
- VieRnes de Bioinformática en el LIIGH [Parte 5](https://github.com/VieRnesBioinformatica/ViernesBioinfo2026_parte5) - (20 feb - 22 de mayo, 2026) 
]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/ViernesBioinfo_logo.png" alt="" width="80%" style="display: block; margin: auto;" />
]

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## Temas

.pull-left[
- Introducción a **R, Python y Bash**
- Manipulación de datos (vector, dataframe, matriz)
- El ABC de las **funciones y loops**
- Documentación con roxygen
- Introducción a **Quarto y Rmarkdown**
- Visualizaciones graficas con **ggplot2**
- **Git + Github**
- **Bioestadistica**
- Visualizaciones graficas con **ggplot2** y **ComplexHeatmap**
- **Buenas practicas** en bioinformática
- Preparación de data para **GWAS**
- **PCA** en Transcriptómica
- Predicción **miRNAs**
- EcoNiches
]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/allison-horst-code-kitchen.png" alt="" width="100%" style="display: block; margin: auto;" />
]

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## Workshops

.pull-left[
- Workshop. Análisis de datos de **RNA-Seq** (parte 0)
- Nexflow (parte 1)
- Bases para la inferencia **filogenética**, construcción, lectura e interpretación de árboles filogenéticos (parte 2)
- Mini curso de **metagenómica** (parte 3)
- Llamado de **variantes genéticas** (parte 3)
- **Leaving Academia** - Mi camino profesional tras dejar la academia (parte 4)
]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/rmarkdown_wizards.png" alt="" width="100%" style="display: block; margin: auto;" />
]

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## Proyectos de la Comunidad

.pull-left[
- **Dr. Jose Luis Tellez** - *C. elegans* como modelo de estudio de enfermedades raras y resistencia a antiparasitarios
- **Dr. Diego Cortes** - Reducción del cromosoma Y | Tortugas, lagartijas 
- **Dr. Claudia Gonzaga** - Enfermedades raras | Variantes estructurales
- **Dr. Federico Sánchez** - Explorando la historia evolutiva y la genética poblacional en México a través de datos paleogenómicos
]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/debugging.jpg" alt="" width="100%" style="display: block; margin: auto;" />
]

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## STAFF: VieRnes de Bioinformática en el LIIGH

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## Instructores de este semestre

.pull-left[
- Pavel Salazar Fernández - Estudiante de doctorado, Doctorado en Ciencias Biomédicas, LIIGH-UNAM
- Dr. Santiago Rosas - Posdoctorante, LIIGH-UNAM
- Dra. Evelia Coss - Posdoctorante, LIIGH-UNAM
- Dr. Israel Aguilar - Posdoctorante, Tec de Monterrey
- Emilio Ortiz-Avila - Tesista de licenciatura, UAQ-UNAM.
- Dra. Laura Gómez - Inmegen
- Dra. Haydeé Peruyero - Rladies Morelia, Profesora Investigadora, ENES-Juriquilla
- Sofia Zorrilla - Rladies Morelia, estudiante de maestria PCBIOL en ENES Morelia
]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/horst_rstudio_air.png" alt="" width="120%" style="display: block; margin: auto;" />
]

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.left[.footnote[.black[
Imagen tomada de: [Comunidades bioinformáticas sin fronteras](https://biotecmov.ibt.unam.mx/numeros/40/6.html)
]]]

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.center[
.content-box-blue[
Gracias a cada persona que ha sido parte de este camino. 
Este espacio es nuestra manera de **aprender, compartir y crecer juntos**.
]]

**STAFF**

- Dra. Evelia Coss
- Dr. Israel Aguilar
- Jorge Alfredo Suazo

**Coordinación del LIIGH**

- Dra. Daniela Robles 
- Dr. Federico Sánchez
- Dra. María C. Ávila Arcos 
- Eglee Lomelin 
- Luis Aguilar
- Jair Santiago García
]

.center-col[
**Instructores**
- Sofia Salazar
- Dr. Domingo Martínez
- Dr. Obed Ramirez
- Dr. Shaday Guerrero
- Dra. Haydeé Peruyero 
- Dra. Joselyn Chávez 
- Dr. Santiago Rosas
- Dra. Laura Gómez
- Dra. Aline Pingarroni 
- Oscar Aldana
- Alejandra Schafer
- Jazmín López Chacón
- Quetzally Medina
- Jorge Alfredo Suazo 
- Maria Fernanda Miron Toruno 
- Emilio Ortiz-Avila
]

.right-col[
- Sofía Zorrilla Azcué
- Maria Jose Palma Martinez
- Johana Galguera
- Dr. David Valle García
- Angélica de Luna García
- Brenda Eloisa Sanchez Pichardo
- María Guadalupe Segovia Ramírez
- Alejandra Paulina Pérez González
- Andrea Maria Torres Iribe
- Josué Guzmán Linares
- Karla Guzmán Barrenechea
- Dr. Alan Michael Torres Calderon
- Armando Sunny
]

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No es un adiós es un hasta luego

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## Nuestras Redes sociales

<div style="display:flex; justify-content:center; align-items:center;">
  <div style="display:flex; justify-content:space-around; width:80%; text-align:center;">
    <div>
      <img src="figures/EveCoss.jpg" style="width:150px; height:150px; border-radius:50%; object-fit:cover;"><br>
      <b>Evelia Coss</b><br>
      Coordinadora<br>Instructora
    </div>
    </div>
    </div>
.center[
[<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 496 512" style="height:2em;width:1.94em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M165.9 397.4c0 2-2.3 3.6-5.2 3.6-3.3.3-5.6-1.3-5.6-3.6 0-2 2.3-3.6 5.2-3.6 3-.3 5.6 1.3 5.6 3.6zm-31.1-4.5c-.7 2 1.3 4.3 4.3 4.9 2.6 1 5.6 0 6.2-2s-1.3-4.3-4.3-5.2c-2.6-.7-5.5.3-6.2 2.3zm44.2-1.7c-2.9.7-4.9 2.6-4.6 4.9.3 2 2.9 3.3 5.9 2.6 2.9-.7 4.9-2.6 4.6-4.6-.3-1.9-3-3.2-5.9-2.9zM244.8 8C106.1 8 0 113.3 0 252c0 110.9 69.8 205.8 169.5 239.2 12.8 2.3 17.3-5.6 17.3-12.1 0-6.2-.3-40.4-.3-61.4 0 0-70 15-84.7-29.8 0 0-11.4-29.1-27.8-36.6 0 0-22.9-15.7 1.6-15.4 0 0 24.9 2 38.6 25.8 21.9 38.6 58.6 27.5 72.9 20.9 2.3-16 8.8-27.1 16-33.7-55.9-6.2-112.3-14.3-112.3-110.5 0-27.5 7.6-41.3 23.6-58.9-2.6-6.5-11.1-33.3 2.6-67.9 20.9-6.5 69 27 69 27 20-5.6 41.5-8.5 62.8-8.5s42.8 2.9 62.8 8.5c0 0 48.1-33.6 69-27 13.7 34.7 5.2 61.4 2.6 67.9 16 17.7 25.8 31.5 25.8 58.9 0 96.5-58.9 104.2-114.8 110.5 9.2 7.9 17 22.9 17 46.4 0 33.7-.3 75.4-.3 83.6 0 6.5 4.6 14.4 17.3 12.1C428.2 457.8 496 362.9 496 252 496 113.3 383.5 8 244.8 8zM97.2 352.9c-1.3 1-1 3.3.7 5.2 1.6 1.6 3.9 2.3 5.2 1 1.3-1 1-3.3-.7-5.2-1.6-1.6-3.9-2.3-5.2-1zm-10.8-8.1c-.7 1.3.3 2.9 2.3 3.9 1.6 1 3.6.7 4.3-.7.7-1.3-.3-2.9-2.3-3.9-2-.6-3.6-.3-4.3.7zm32.4 35.6c-1.6 1.3-1 4.3 1.3 6.2 2.3 2.3 5.2 2.6 6.5 1 1.3-1.3.7-4.3-1.3-6.2-2.2-2.3-5.2-2.6-6.5-1zm-11.4-14.7c-1.6 1-1.6 3.6 0 5.9 1.6 2.3 4.3 3.3 5.6 2.3 1.6-1.3 1.6-3.9 0-6.2-1.4-2.3-4-3.3-5.6-2z"/></svg>](https://github.com/EveliaCoss) [<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 448 512" style="height:2em;width:1.75em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M224.1 141c-63.6 0-114.9 51.3-114.9 114.9s51.3 114.9 114.9 114.9S339 319.5 339 255.9 287.7 141 224.1 141zm0 189.6c-41.1 0-74.7-33.5-74.7-74.7s33.5-74.7 74.7-74.7 74.7 33.5 74.7 74.7-33.6 74.7-74.7 74.7zm146.4-194.3c0 14.9-12 26.8-26.8 26.8-14.9 0-26.8-12-26.8-26.8s12-26.8 26.8-26.8 26.8 12 26.8 26.8zm76.1 27.2c-1.7-35.9-9.9-67.7-36.2-93.9-26.2-26.2-58-34.4-93.9-36.2-37-2.1-147.9-2.1-184.9 0-35.8 1.7-67.6 9.9-93.9 36.1s-34.4 58-36.2 93.9c-2.1 37-2.1 147.9 0 184.9 1.7 35.9 9.9 67.7 36.2 93.9s58 34.4 93.9 36.2c37 2.1 147.9 2.1 184.9 0 35.9-1.7 67.7-9.9 93.9-36.2 26.2-26.2 34.4-58 36.2-93.9 2.1-37 2.1-147.8 0-184.8zM398.8 388c-7.8 19.6-22.9 34.7-42.6 42.6-29.5 11.7-99.5 9-132.1 9s-102.7 2.6-132.1-9c-19.6-7.8-34.7-22.9-42.6-42.6-11.7-29.5-9-99.5-9-132.1s-2.6-102.7 9-132.1c7.8-19.6 22.9-34.7 42.6-42.6 29.5-11.7 99.5-9 132.1-9s102.7-2.6 132.1 9c19.6 7.8 34.7 22.9 42.6 42.6 11.7 29.5 9 99.5 9 132.1s2.7 102.7-9 132.1z"/></svg>](https://www.instagram.com/eveliacoss/) [<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 512 512" style="height:2em;width:2em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M64 112c-8.8 0-16 7.2-16 16v22.1L220.5 291.7c20.7 17 50.4 17 71.1 0L464 150.1V128c0-8.8-7.2-16-16-16H64zM48 212.2V384c0 8.8 7.2 16 16 16H448c8.8 0 16-7.2 16-16V212.2L322 328.8c-38.4 31.5-93.7 31.5-132 0L48 212.2zM0 128C0 92.7 28.7 64 64 64H448c35.3 0 64 28.7 64 64V384c0 35.3-28.7 64-64 64H64c-35.3 0-64-28.7-64-64V128z"/></svg>](mailto:ecossnav@gmail.com)
]]

.center[
[<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 496 512" style="height:2em;width:1.94em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M165.9 397.4c0 2-2.3 3.6-5.2 3.6-3.3.3-5.6-1.3-5.6-3.6 0-2 2.3-3.6 5.2-3.6 3-.3 5.6 1.3 5.6 3.6zm-31.1-4.5c-.7 2 1.3 4.3 4.3 4.9 2.6 1 5.6 0 6.2-2s-1.3-4.3-4.3-5.2c-2.6-.7-5.5.3-6.2 2.3zm44.2-1.7c-2.9.7-4.9 2.6-4.6 4.9.3 2 2.9 3.3 5.9 2.6 2.9-.7 4.9-2.6 4.6-4.6-.3-1.9-3-3.2-5.9-2.9zM244.8 8C106.1 8 0 113.3 0 252c0 110.9 69.8 205.8 169.5 239.2 12.8 2.3 17.3-5.6 17.3-12.1 0-6.2-.3-40.4-.3-61.4 0 0-70 15-84.7-29.8 0 0-11.4-29.1-27.8-36.6 0 0-22.9-15.7 1.6-15.4 0 0 24.9 2 38.6 25.8 21.9 38.6 58.6 27.5 72.9 20.9 2.3-16 8.8-27.1 16-33.7-55.9-6.2-112.3-14.3-112.3-110.5 0-27.5 7.6-41.3 23.6-58.9-2.6-6.5-11.1-33.3 2.6-67.9 20.9-6.5 69 27 69 27 20-5.6 41.5-8.5 62.8-8.5s42.8 2.9 62.8 8.5c0 0 48.1-33.6 69-27 13.7 34.7 5.2 61.4 2.6 67.9 16 17.7 25.8 31.5 25.8 58.9 0 96.5-58.9 104.2-114.8 110.5 9.2 7.9 17 22.9 17 46.4 0 33.7-.3 75.4-.3 83.6 0 6.5 4.6 14.4 17.3 12.1C428.2 457.8 496 362.9 496 252 496 113.3 383.5 8 244.8 8zM97.2 352.9c-1.3 1-1 3.3.7 5.2 1.6 1.6 3.9 2.3 5.2 1 1.3-1 1-3.3-.7-5.2-1.6-1.6-3.9-2.3-5.2-1zm-10.8-8.1c-.7 1.3.3 2.9 2.3 3.9 1.6 1 3.6.7 4.3-.7.7-1.3-.3-2.9-2.3-3.9-2-.6-3.6-.3-4.3.7zm32.4 35.6c-1.6 1.3-1 4.3 1.3 6.2 2.3 2.3 5.2 2.6 6.5 1 1.3-1.3.7-4.3-1.3-6.2-2.2-2.3-5.2-2.6-6.5-1zm-11.4-14.7c-1.6 1-1.6 3.6 0 5.9 1.6 2.3 4.3 3.3 5.6 2.3 1.6-1.3 1.6-3.9 0-6.2-1.4-2.3-4-3.3-5.6-2z"/></svg>](https://github.com/Iaguilaror) [<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 448 512" style="height:2em;width:1.75em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M0 32v448h448V32H0zm262.2 334.4c-6.6 3-33.2 6-50-14.2-9.2-10.6-25.3-33.3-42.2-63.6-8.9 0-14.7 0-21.4-.6v46.4c0 23.5 6 21.2 25.8 23.9v8.1c-6.9-.3-23.1-.8-35.6-.8-13.1 0-26.1.6-33.6.8v-8.1c15.5-2.9 22-1.3 22-23.9V225c0-22.6-6.4-21-22-23.9V193c25.8 1 53.1-.6 70.9-.6 31.7 0 55.9 14.4 55.9 45.6 0 21.1-16.7 42.2-39.2 47.5 13.6 24.2 30 45.6 42.2 58.9 7.2 7.8 17.2 14.7 27.2 14.7v7.3zm22.9-135c-23.3 0-32.2-15.7-32.2-32.2V167c0-12.2 8.8-30.4 34-30.4s30.4 17.9 30.4 17.9l-10.7 7.2s-5.5-12.5-19.7-12.5c-7.9 0-19.7 7.3-19.7 19.7v26.8c0 13.4 6.6 23.3 17.9 23.3 14.1 0 21.5-10.9 21.5-26.8h-17.9v-10.7h30.4c0 20.5 4.7 49.9-34 49.9zm-116.5 44.7c-9.4 0-13.6-.3-20-.8v-69.7c6.4-.6 15-.6 22.5-.6 23.3 0 37.2 12.2 37.2 34.5 0 21.9-15 36.6-39.7 36.6z"/></svg>](https://www.researchgate.net/profile/Israel-Aguilar-Ordonez) [<svg aria-hidden="true" role="img" viewBox="0 0 512 512" style="height:2em;width:2em;vertical-align:-0.125em;margin-left:auto;margin-right:auto;font-size:inherit;fill:currentColor;overflow:visible;position:relative;"><path d="M64 112c-8.8 0-16 7.2-16 16v22.1L220.5 291.7c20.7 17 50.4 17 71.1 0L464 150.1V128c0-8.8-7.2-16-16-16H64zM48 212.2V384c0 8.8 7.2 16 16 16H448c8.8 0 16-7.2 16-16V212.2L322 328.8c-38.4 31.5-93.7 31.5-132 0L48 212.2zM0 128C0 92.7 28.7 64 64 64H448c35.3 0 64 28.7 64 64V384c0 35.3-28.7 64-64 64H64c-35.3 0-64-28.7-64-64V128z"/></svg>](mailto:iaguilaror@gmail.com)
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## Postulación a **GitHub Star**

.pull-left[
- Les pedimos que nos propongan en [GitHub Star](https://stars.github.com/).
- No hay ganadores mexicanos y no gustaría serlo. 
]

.pull-right[
<img src="data:image/png;base64,#figures/githubstar.png" alt="" width="60%" style="display: block; margin: auto;" />
]

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Recuerden colocar sus asistencias y la semana que viene se les estará enviando através de nuestro correo: <viernesbioinfo@gmail.com>

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Respira y coméntame tus dudas.