Lista de Reproducción Parte 0

Parte 0

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Viernes 1: Conceptos básicos de bioinformática y pseudocódigo

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• Fecha: Viernes 22 de Septiembre 2023

• Instructora: Dra. Evelia Coss

• Presentación: Conceptos básicos de bioinformática y pseudocódigo

• Grabación: Viernes 1

• Lecturas y cursos recomendados:

  • Summer R 2015

  • Bioinformatica, NIH, 2023

  • Bioinformática: “Welcome to the Welcome”, Julio Collado Vides, CCG

  • Pseudocodigo, Diagramas de Flujo y algo de C de Pascual Coronel

  • R: Introduction and Data Management

Viernes 2: Introducción a R, parte 1

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• Fecha: Viernes 29 de Septiembre 2023

• Instructora: LCG. Sofia Salazar

• Presentación: Introducción a R, parte 1

• Grabación:

  • Viernes 2- En vivo Clase
  • Video de Sofi

• Lecturas y cursos recomendados:

  • R for dummies

  • R for beginners

Viernes 3: Introducción a R, parte 2

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• Fecha: Viernes 6 de Octubre 2023

• Instructora: LCG. Sofia Salazar

• Presentación: Introducción a R, parte 2

• Grabación: Viernes 3

• Lecturas y cursos recomendados:

  • R for dummies

  • R for beginners

  • R para principiantes

Viernes 4. Manipulación de datos con R

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• Fecha: Viernes 13 de Octubre 2023

• Instructora: Dra. Evelia Coss

• Presentación:

  • Manipulación de datos con R

  • Rscript

• Grabación: Viernes 4 - En vivo

• Lecturas y cursos recomendados:

  • dplyr Github

  • Keep or drop columns using their names and types

Viernes 5. El ABC de las funciones y loops en R

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• Fecha: Viernes 20 de Octubre 2023

• Instructora: Dra. Evelia Coss

• Presentación:

  • El ABC de las funciones y loops en R

  • SquareX_function.R

• Grabación: Viernes 5 - En vivo

• Lecturas y cursos recomendados:

  • R para principiantes, Cap 8, Cap 9, Cap 10

  • Software Carpentry, funciones

  • Software Carpentry, funciones de apply

  • Software Carpentry, Intermediate programming with R

  • Funciones apply, lapply, sapply, tapply, mapply y vapply en R

  • Error handling and assertions in R

  • assertthat

  • Hands-On programming with R

  • How to write Pseudocode: A beginner’s guide

Viernes 6. Visualización grafica con ggplot2

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• Fecha: Viernes 27 de Octubre 2023

• Instructora: Fernanda Mirón Toruño

• Scripts: boxplot.R

• Grabación: Viernes 6 - En vivo

• Lecturas y cursos recomendados:

Sábado. Shiny app

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• Fecha: Viernes 11 de Noviembre 2023

• Instructora: Jazmín López Chacón

• Material: Github - VieRnesShiny

• Grabación: Video - En vivo

Viernes 7 y 8. Exploración de datos y elección de pruebas o modelos

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• Material clase del 7 y 8 de Diciembre

• Presentación: Clase 7

• Grabación:

  • Viernes 7

• Viernes 8(Link Caido)