PARTE 4

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Playlist de Youtube

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Viernes 1. (5/sep/2025) Leaving Academia 1\

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• 11:30 a 12:30 - Información general del curso - Evelia Coss e Israel Aguilar\

• 12:30 a 13:30 - Leaving Academia - Mi camino profesional tras dejar la academia - Emmanuel Rojas Morales

Viernes 2. (12/sep/2025) Leaving Academia 2\

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• 11:30 a 12:30 - Leaving Academia - Mi camino profesional tras dejar la academia - Antonio Martínez Gutiérrez\

• 12:30 a 13:30 - La IA como herramienta de programación: chatGPT - Israel Aguilar

Viernes 3. (19/sep/2025) PLINK\

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• 11:30 a 13:30 - Preparación de data para GWAS - Angélica de Luna García

  Artículo recomendado: A tutorial on conducting genome‐wide association studies: Quality control and statistical analysis
  Datos descargables para el ejercicio: https://github.com/MareesAT/GWA_tutorial/
  Notas de la profesora: https://docs.google.com/document/d/1ueirFtDEdG4hUMMWLL_69VT9YfMi2dvd_az1WFrUsH4/edit?usp=sharing

Viernes 4. (26/sep/2025) Leaving Academia 3\

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• 11:30 a 12:30 - Leaving Academia - Mi camino profesional tras dejar la academia - María Guadalupe Segovia Ramírez\

• 12:30 a 13:30 - Proyectos de la Comunidad - Evelia Coss 12:30 - Dr. Diego Cortez Quezada, investigador de CCG

Viernes 5. (03/oct/2025) - Clasificación con abundancia taxonómica\

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• 11:30 a 13:30 - Clasificando microbios: una introducción al microbioma y al aprendizaje supervisado - Brenda Eloisa Sanchez Pichardo

  • Link a notebook: https://drive.google.com/drive/folders/1zt35oBBHiEpDtJd0VjgntP9vihuOcPlN?usp=share_link

Viernes 6. (10/oct/2025) - PCA en Transcriptómica\

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• 11:30 a 13:30 - Anáisis de Componentes Principales en datos Transcriptómicos - Alejandra Paulina Pérez González

  • Link a script de la clase: https://raw.githubusercontent.com/VieRnesBioinformatica/ViernesBioinfo2025_parte4/refs/heads/main/scripts/PCA.R

Viernes 7. (17/oct/2025) - Reproducibilidad Bioinformática\

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• 11:30 a 13:30 - Recreando una figura de un artículo en R - Josué Guzmán Linares

  Link a scripts de la clase:

  • https://raw.githubusercontent.com/VieRnesBioinformatica/ViernesBioinfo2025_parte4/refs/heads/main/scripts/nyt_heatmap.R

  • https://raw.githubusercontent.com/VieRnesBioinformatica/ViernesBioinfo2025_parte4/refs/heads/main/scripts/tidyheatmap.R

Viernes 8. (24/oct/2025) - Predicción miRNAs\

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• 11:30 a 13:30 - Predicción de genes blanco y vías funcionales en miRNAs - Andrea Maria Torres Iribe

• Link a scripts de la clase:

  • https://raw.githubusercontent.com/VieRnesBioinformatica/ViernesBioinfo2025_parte4/refs/heads/main/scripts/clase_mirna_script_21_10_25.R

Viernes 9. (31/oct/2025) - Diferentes caminos para hacer Bioinformática\

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• 11:30 a 13:30 - Proyectos de la Comunidad - Israel Aguilar

Viernes 10. (07/nov/2025) - Creación de gráficos con ggplot2\

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• 11:30 a 13:30 - Creación de gráficos con ggplot2 - Fernanda Mirón Toruño

• Link a scripts de la clase:

  • https://raw.githubusercontent.com/fernanda-miron/Viernes-de-Bioinformatica/refs/heads/main/ggplot2_script.R

Viernes 13. (28/nov/2025) - Llamado de Variantes Quick\

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• 11:30 a 13:30 - Tutorial nf-core/sarek - Karla Guzmán Barrenechea

Viernes 14. TBA (05/dic/2025) - ¡Cómo preparar tus bases de datos!\

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• 11:30 a 13:30 - Preparing databases for mapping and variant calling in cancer research - Alan Michael Torres Calderon

• Link a scripts y documentación de la clase:

  • https://github.com/mike-bioinfo/tutorial-databases-cancer

• Viernes 15. TBA (12/dic/2025) - EcoNiches
  11:30 a 13:30 - Tutorial del paquete R: EcoNiches - Armando Sunny